北京市二十一世紀(jì)國(guó)際學(xué)校初中部現(xiàn)有18個(gè)教學(xué)班，學(xué)生495人，教師52人。其中高級(jí)職稱教師占49%，自2010年與北京十一學(xué)校聯(lián)合辦學(xué)以來(lái)教師隊(duì)伍質(zhì)量明顯提高，2012屆中考成績(jī)?cè)诤５韰^(qū)排名第21位（其中化學(xué)第15名，英語(yǔ)第16名），創(chuàng)二十一世紀(jì)歷史之最，體現(xiàn)了初中部“創(chuàng)新教育理念，提高教學(xué)質(zhì)量，建設(shè)學(xué)部特色”辦學(xué)成果。

初中部教學(xué)設(shè)備先進(jìn)，教學(xué)設(shè)施齊全。有專用的音樂(lè)教室、美術(shù)教室、舞蹈教室、傳媒教室、微機(jī)教室、生物教室、物理實(shí)驗(yàn)室、化學(xué)實(shí)驗(yàn)室、演播室。學(xué)校有廣播電視中心，每周都有學(xué)生主持主編的校園新聞播報(bào)。

初中部管理方面做到領(lǐng)導(dǎo)管理育人，老師教書(shū)育人，職工服務(wù)育人。半軍事化、規(guī)范化、科學(xué)化的管理，為學(xué)生的身心健康提供了可靠的保障；學(xué)生住宿3—4人一個(gè)房間，條件優(yōu)裕；食堂實(shí)行營(yíng)養(yǎng)配餐，每周的食譜都在校園網(wǎng)上登錄，學(xué)生和學(xué)生家長(zhǎng)可以查閱，隨時(shí)可提出意見(jiàn)。

初中部根據(jù)學(xué)生來(lái)源特點(diǎn)，特別重視年級(jí)組管理。年級(jí)組長(zhǎng)都是教學(xué)管理經(jīng)驗(yàn)豐富的優(yōu)秀教師擔(dān)任，根據(jù)年級(jí)特點(diǎn)安排不同的主題活動(dòng)。初一年級(jí)的“邁好中學(xué)第一步”系列活動(dòng)，讓初一新生一入學(xué)就很快融入到嶄新的初中生活；初二年級(jí)主題活動(dòng)為“邁好青春第一步”， 增加了學(xué)生的社會(huì)責(zé)任感；初三年級(jí)的主題活動(dòng)為“奮力拼搏，決勝中考“，引導(dǎo)學(xué)生以良好的心態(tài)和斗志，昂揚(yáng)的精神面貌，迎接挑戰(zhàn)，沖刺中考，鑄造輝煌。

小班化教學(xué)也是初中部教學(xué)特色之一，課堂特點(diǎn)是“我的課堂，我做主”，學(xué)生是課堂的主體。

學(xué)部每學(xué)期都安排各種各樣的校內(nèi)外活動(dòng)，豐富了學(xué)生的校園生活，提高了學(xué)生的綜合能力。例如校內(nèi)的英語(yǔ)角活動(dòng)、圣誕歌會(huì)、詩(shī)歌朗誦、社團(tuán)活動(dòng)、英語(yǔ)夏令營(yíng)、拓展活動(dòng)以及一年一次的運(yùn)動(dòng)會(huì)。校外活動(dòng)有每年寒暑假的出國(guó)交流學(xué)習(xí)活動(dòng)，幾年來(lái)，初中部有176名學(xué)生出國(guó)學(xué)習(xí)取得“英語(yǔ)合格”的資格證書(shū)。